A Secretaria de Saúde é responsável por coordenar uma ampla estrutura voltada à promoção da saúde pública no município. Suas principais atribuições incluem a supervisão de departamentos, como o almoxarifado, encaminhamentos fora de domicílio, pessoal, controle e avaliação, além da coordenação dos programas de saúde da família e outras iniciativas.

A secretaria também cuida da distribuição de medicamentos, gestão de tratamentos fora do município, manutenção de unidades de saúde, coordenação de vigilância em saúde e o controle de doenças. Além disso, ela fiscaliza e acompanha a execução de convênios e recursos destinados à saúde.

Possui a seguinte estrutura básica:

I. Supervisão de Departamento
I.II – Assessoria de Informática;
I.III – Departamento de Agendamento e Tratamento Fora de Domicilio;
I.IV – Departamento de Programas da Saúde;
I.V – Departamento de Vigilância Sanitária;
I.VI – Departamento de Saúde da Família;
I.VII – Departamento de Pronto Atendimento;
I.VIII – Departamento de Controle e Avaliação.